Durante el proceso judicial del caso Medusa, el Ministerio Público ha logrado alcanzar acuerdos con los imputados por un total de RD$167,563,370.44, tanto en beneficio del Estado dominicano como del propio órgano acusador.
Estos acuerdos se han materializado a través de incautaciones durante la investigación y mediante convenios con algunos de los implicados, quienes han reconocido su participación y culpabilidad en los hechos imputados por el Ministerio Público.
Uno de los principales acuerdos fue con Francesco Cardi, quien entregó voluntariamente al Ministerio Público la suma de RD$2,000,000.00 que había recibido, y no se opuso al decomiso de este dinero.
Jean Alain Rodríguez, el principal acusado, realizó una compra fraudulenta de un apartamento que estaba destinado para la construcción de parqueos de la Fiscalía del Distrito Nacional. Este apartamento fue entregado voluntariamente al Ministerio Público para su decomiso.
Hasta la fecha, al menos 24 personas físicas y jurídicas han aceptado su culpabilidad y han llegado a acuerdos con el Ministerio Público, lo que les podría significar una reducción en su condena. Algunos de los implicados también deberán pagar multas estipuladas por el órgano acusador, en algunos casos equivalentes al monto recibido por sobornos.
Lisandro José Macarrulla Martínez es uno de los acusados que aceptó su implicación en la estructura de corrupción y deberá pagar una suma considerable, además de entregar un apartamento como parte del acuerdo.
José Antonio Santana Julián y Ricardo Antonio Carrasquero Frías también han aceptado su culpabilidad y deberán pagar multas y otras penalidades estipuladas por el Ministerio Público.
Además de las personas físicas, 22 razones sociales están implicadas en el caso. Algunas de estas empresas también han llegado a acuerdos con el Ministerio Público y deberán pagar multas y otras penalidades en beneficio del Estado dominicano.